Od první Phantasy Star, ve které hrdinka Alis porazila zlo symbolizované entitou Darkfalz, uplynulo už celé milénium. Planeta Motavia z planetárního systému Algol již není pokrytá pouští, jelikož lidé postavili počítač nazvaný "Mother Brain", který dokáže regulovat klima planety a přetvořit ji na utopii. Jednou v noci se mladý motavijský agent jménem Rolf probudí z noční můry, ve které viděl, jak mladá neznámá dívka bojuje s démonem, ale nebyl schopen jí pomoci. Krátce nato se dozvídá, že z laboratoře utekly bio-monstra. Rolf se snaží dostat do laboratoří, aby získal audiozáznam, na kterém jsou nahrané poslední události před incidentem...
Stejně jako předchůdce je i druhý díl série japonským RPG, ve kterém cestujete po světě a bojujete v tahových soubojích s monstry, objevujícími se v náhodných setkáních. Ve své partě můžete mít až osm postav, jenomže boje se můžou účastnit pouze čtyři, a proto z nich můžete před každou bitvou vybírat. Dungeony byly oproti předchůdci změněny a nyní jsou ze stejného pohledu (2D pohled shora) jako explorační část hry.
@aDOSt (15.06.2022 12:09): To vis, kdysi tyhle věci na CRT TV tak netloukli do oči :)